MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 6074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013385	T	6	6	41	46	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013385	G	7	7	175	181	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013385	CAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013385	ACT	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013385	TGA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013385	ATTTT	2	10	10087	10096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013385	T	6	6	10093	10098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013385	AGG	2	6	12881	12886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013385	T	6	6	14428	14433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013385	CCT	2	6	15605	15610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013385	CAG	2	6	15682	15687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013385	CCT	2	6	15719	15724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013385	A	6	6	16124	16129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013385	GAG	2	6	16205	16210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013385	CCA	2	6	16896	16901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013385	CGG	2	6	16936	16941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013385	AG	3	6	16942	16947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013385	CTT	2	6	17295	17300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013385	AGG	2	6	17430	17435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013385	TCCC	2	8	17531	17538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013385	CCG	2	6	17569	17574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013385	CGG	2	6	17604	17609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013385	GA	3	6	17748	17753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013385	TC	3	6	17766	17771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013385	CGG	2	6	17779	17784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013385	CG	3	6	17796	17801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013385	AG	3	6	17879	17884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013385	GA	3	6	17885	17890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013385	C	6	6	18042	18047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_013385	CGAT	2	8	18085	18092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013385	CGG	2	6	18129	18134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013385	GAA	3	9	18154	18162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013385	ACC	2	6	18182	18187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013385	GAG	2	6	18195	18200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013385	AG	3	6	18199	18204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013385	CCT	2	6	22053	22058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013385	GAA	2	6	22353	22358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013385	CTT	2	6	22362	22367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013385	TGAGC	2	10	22396	22405	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013385	CGCGT	2	10	22464	22473	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013385	CTT	2	6	22484	22489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013385	CAC	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_013385	CCT	2	6	22585	22590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013385	CGG	2	6	22657	22662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013385	GGAA	2	8	22671	22678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013385	TCG	2	6	23010	23015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013385	GAA	2	6	23018	23023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013385	GAAA	2	8	23036	23043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013385	GCC	2	6	23054	23059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013385	A	6	6	23890	23895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013385	TG	3	6	23927	23932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013385	TAAG	2	8	25314	25321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013385	GATAAA	2	12	25371	25382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013385	ATACT	2	10	26791	26800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013385	AGGGA	2	10	27530	27539	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013385	GGT	2	6	27557	27562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013385	T	6	6	27566	27571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013385	GAG	2	6	27597	27602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013385	AGA	2	6	27809	27814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013385	AGG	2	6	28631	28636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013385	AAC	2	6	30430	30435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013385	CAC	2	6	33690	33695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013385	CAC	2	6	34534	34539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013385	GGC	2	6	34558	34563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013385	GAG	2	6	34582	34587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013385	GGGA	2	8	34596	34603	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013385	AGG	2	6	35300	35305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013385	TGG	2	6	35356	35361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013385	GGC	2	6	35366	35371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013385	AAC	2	6	35421	35426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013385	CAG	2	6	35433	35438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013385	TGG	2	6	35497	35502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013385	CGGC	2	8	35507	35514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013385	TCC	2	6	35535	35540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013385	GCA	2	6	35546	35551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013385	ATG	2	6	35556	35561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013385	TCC	2	6	35577	35582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013385	CAG	2	6	35724	35729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013385	CTT	2	6	35731	35736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013385	ACC	2	6	35835	35840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013385	GTG	2	6	35964	35969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013385	TGG	2	6	36004	36009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013385	CCA	2	6	36019	36024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013385	CGG	2	6	36087	36092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013385	GTG	2	6	36098	36103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013385	AGGG	2	8	36120	36127	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013385	AG	3	6	36148	36153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013385	GGA	2	6	36181	36186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013385	GGA	2	6	36295	36300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013385	GAC	2	6	36350	36355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013385	GTG	2	6	36362	36367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013385	CGG	2	6	36432	36437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013385	GGAA	2	8	36513	36520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013385	GCG	2	6	36588	36593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013385	GAA	2	6	36596	36601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013385	CAC	2	6	36622	36627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013385	CGG	2	6	36628	36633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013385	C	6	6	36653	36658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
99	NC_013385	TTC	2	6	36692	36697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013385	GGC	2	6	36699	36704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013385	A	7	7	36716	36722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013385	TCCC	2	8	36726	36733	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_013385	CTAA	2	8	36764	36771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013385	AG	3	6	36845	36850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013385	GGGA	2	8	36927	36934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013385	TTA	2	6	39253	39258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013385	CGT	2	6	39264	39269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013385	TAAC	2	8	39290	39297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013385	GGA	2	6	39303	39308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013385	AAGG	2	8	40469	40476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013385	AGA	2	6	40483	40488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013385	GA	3	6	40487	40492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013385	GCT	2	6	40520	40525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013385	ACT	2	6	40532	40537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013385	AG	3	6	40540	40545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013385	GCT	2	6	42045	42050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013385	CTA	2	6	42058	42063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013385	CGG	2	6	42156	42161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013385	CCG	2	6	42237	42242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013385	GGT	2	6	42291	42296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013385	AAT	2	6	49672	49677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013385	AGG	2	6	49721	49726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013385	GGT	2	6	50428	50433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013385	ATC	2	6	52015	52020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013385	CTC	2	6	54350	54355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013385	CTG	2	6	54412	54417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013385	AG	3	6	54471	54476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013385	GGA	2	6	54691	54696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013385	GAG	2	6	58772	58777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013385	AGC	2	6	58784	58789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013385	GCG	2	6	58869	58874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013385	GAG	2	6	60798	60803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013385	CTG	2	6	60860	60865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013385	TCC	2	6	60866	60871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013385	AGG	2	6	60901	60906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013385	T	6	6	60950	60955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013385	AAGG	2	8	63037	63044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013385	AGC	2	6	63047	63052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013385	AGA	2	6	66767	66772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013385	TA	3	6	66773	66778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013385	AC	3	6	66800	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013385	A	8	8	66860	66867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013385	GAGG	2	8	67130	67137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013385	GTT	2	6	67567	67572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013385	AGG	2	6	67583	67588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013385	CTA	2	6	68427	68432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013385	AGGA	2	8	68437	68444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013385	ACA	2	6	113138	113143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_013385	AGG	2	6	113215	113220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_013385	GGGGA	2	10	135246	135255	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
412	NC_013385	CTC	2	6	142582	142587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_013385	AGG	2	6	142630	142635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
414	NC_013385	CTGA	2	8	143345	143352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
415	NC_013385	GTT	2	6	143357	143362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
416	NC_013385	ACAA	2	8	143378	143385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
417	NC_013385	TGT	2	6	143414	143419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
418	NC_013385	GTT	2	6	143455	143460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
419	NC_013385	AGAA	2	8	145161	145168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
420	NC_013385	GTC	2	6	145221	145226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_013385	TGCC	2	8	145248	145255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
422	NC_013385	GGGA	2	8	145265	145272	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
423	NC_013385	TGC	2	6	145356	145361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_013385	GCCT	2	8	146843	146850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
426	NC_013385	TCT	2	6	146869	146874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_013385	TGC	2	6	146882	146887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_013385	CTGA	2	8	146925	146932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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449	NC_013385	AGG	2	6	153884	153889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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